El Algeciras CF a lo largo de sus más de cien años de historia ha conseguido numerosos títulos en categoría nacional así como trofeos veraniegos de renombre como pueden ser el Trofeo Ciudad de El Puerto o el Ciudad de La Línea.

1 Tercer puesto 2ª División A, temporada 1965-66, mejor puesto histórico.
1 Campeonato de 2ª División B, temporada 2002-03.
2 Subcampeonatos de 2ª División B, temporadas 1977-78, 1982-83.
6 Campeonatos de 3ª División, temporadas 1955-56, 1961-62, 1987-88, 1999-00, 2006-07, 2012-13, 2014-15.
3 Subcampeonatos de 3ª División, temporadas 1954-55, 1959-60.

Temporada en Categoría Nacional:

9 Temporadas en 2ª División A.
16 Temporadas en 2ª División B.
40 Temporadas en 3ª División.